Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOPT1Q96IL0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOPT1Q96IL0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms