Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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