Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms