Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UPRTQ96BW1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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UPRTQ96BW1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UPRTQ96BW1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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