Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NGLY1-206ENST00000427041 579 ntTSL 42.04□□□□□ -2.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-211ENST00000548219 325 ntTSL 21.93□□□□□ -2.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRPL1-203ENST00000504901 535 ntTSL 51.78□□□□□ -2.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-215ENST00000524307 3101 ntTSL 21.49□□□□□ -2.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-212ENST00000548467 217 ntTSL 21.13□□□□□ -2.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 314.78□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 27.4
TBRG4Q969Z0 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 311.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 27.4
TBRG4Q969Z0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 27.3
TBRG4Q969Z0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.983e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-209ENST00000455145 902 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 213.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-204ENST00000472646 553 ntTSL 511.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 517.72■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 512.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27.2
TBRG4Q969Z0 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 S100P-201ENST00000296370 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 S100P-202ENST00000513778 313 ntTSL 35.04□□□□□ -1.65e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 225.87■■□□□ 1.734e-6■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 325.87■■□□□ 1.734e-6■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 222.5■■□□□ 1.199e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.829e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 217.91■□□□□ 0.469e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 CYP27A1-203ENST00000445971 903 ntTSL 517.06■□□□□ 0.329e-9■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 27.1
TBRG4Q969Z0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.356e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 515.37■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 213.3□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 210.74□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 49.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.241e-6■■■■■ 27
TBRG4Q969Z0 ATXN1-207ENST00000483954 744 ntTSL 35.4□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt17.53■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt16.95■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 212.22□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 26.9
TBRG4Q969Z0 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.962e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)25.58■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 525.49■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 524.91■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 224.91■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 524.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 523.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 323.54■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 521.07■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 220.97■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 320.88■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 520.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 317.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 514.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 412.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 411.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 26.8
TBRG4Q969Z0 TESC-202ENST00000462502 854 ntTSL 520.37■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 174.2 ms