Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms