Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDAQ92838 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDAQ92838 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms