Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms