Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J2Q8N2K1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2J2Q8N2K1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms