Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPAP2Q8IXW5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms