Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PBRM1Q86U86 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms