Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF554Q86TJ5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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