Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WDR53Q7Z5U6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms