Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms