Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF2Q5BJF6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF2Q5BJF6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms