Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms