Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SP6Q3SY56 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SP6Q3SY56 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms