Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COL24A1Q17RW2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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