Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA3Q16787 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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