Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms