Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK4Q16099 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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