Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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