Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOA1Q15788 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
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