Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKIV2LQ15477 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms