Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRRQ15256 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPRRQ15256 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPRRQ15256 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRRQ15256 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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