Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SMCO1Q147U7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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