Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL4A6Q14031 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms