Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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