Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TUBA3CQ13748 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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