Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CUL3Q13618 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CUL3Q13618 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CUL3Q13618 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CUL3Q13618 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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CUL3Q13618 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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CUL3Q13618 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CUL3Q13618 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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