Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms