Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3BQ13214 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms