Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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