Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACACAQ13085 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACACAQ13085 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms