Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP4Q09028 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms