Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms