Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DHX9Q08211 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms