Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL16A1Q07092 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL16A1Q07092 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms