Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
REG3AQ06141 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
REG3AQ06141 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms