Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNB3Q05901 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms