Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALD1Q05682 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms