Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms