Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms