Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms