Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CAV1Q03135 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms