Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms