Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MAT1AQ00266 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms