Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKOR1P84550 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SKOR1P84550 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms