Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms