Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSCP56915 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GSCP56915 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms